Yi-Chen Lin est née dans une famille de musiciens à Taipei (Taïwan). Elle déménage ensuite à Vienne avec sa famille à l’âge de 8 ans, et se forme alors au violon et au piano. Elle remporte de nombreux concours nationaux et internationaux dans ces disciplines, tout en cultivant en parallèle sa passion pour la direction d'orchestre. Elle parfait son apprentissage à l’Académie de musique et des arts du spectacle de Vienne, et se perfectionne auprès de grands chefs d’orchestre – Zubin Mehta, Alberto Zedda, BernardHaitink et David Zinman.
En juin 2009, Yi-Chen Lin fait ses débuts de chef d'orchestre au Musikverein de Vienne avec l’Orchestre symphonique de la radio de Vienne dans les Deux Portraits op.5 de Bartók.
Depuis lors, elle s’est produite en concert en Italie, Espagne, Slovénie, Allemagne, Autriche ainsi qu’au Portugal ; elle collabore avec de nombreux orchestres : Orchestre de la Tonhalle de Zurich, hr-Sinfonieorchester, Orchestre symphonique de la Radio SWR de Stuttgart, Philharmonique de Bologne, Orchestre philharmonique de Slovénie, Orchestre symphonique de la radio-télévision slovène, Orchestre symphonique de la radio-télévision espagnole (Madrid), Orchestre symphonique portugais, Orchestre de la Communauté de Madrid, Orchestre de la Fondation Carlo-Felice de Gênes, Orchestre national basque et Orchestre symphonique de Ténériffe.
Elle est aussi l’invitée régulière de divers festivals comme le Rossini Opera Festival de Pesaro, la Quinzaine musicale de San Sebastián et le Festival de San Lorenzo (Espagne).
Dans le domaine opératique, elle est invitée par le Théâtre national São Carlos de Lisbonne, le Teatro de la Zarzuela de Madrid (Carmen de Bizet), le Théâtre communal de Bologne (Les Noces de Figaro, Mozart),le Teatro Principal de Palma de Majorque (L'Élixir d'amour, Donizetti) et l'Opéra de Tenerife (Le Voyage à Reims, Rossini).
Durant la saison 2019-2020, elle a fait ses débuts à l'Opéra national de Ljubljana (Slovénie), dirigé l'Orchestre symphonique de Barcelone, l’Orchestre symphonique de la radio-télévision espagnole, l’Orchestre de la Tonhalle de Zurich et a été réinvitée au Teatro Principal de Palma de Majorque pour diriger La Flûte enchantée (Mozart).
Yi-Chen Lin a été choisie parmi de nombreux candidats pour être la nouvelle Kapellmeister et assistante musicale du Deutsche Oper Berlin pour la saison 2020-2021.