Miguel Pérez Iñesta étudie la clarinette, le piano et la danse aux Asturies et la direction d’orchestre à l’Université d’Alcalá de Henares à Madrid, avant de partir pour Berlin où il termine ses études à la Musikhochschule Hanns Eisler et à l’Académie Karajan de l’Orchestre philharmonique de Berlin.
Inspiré par le potentiel narratif de l’espace et par une compréhension du son en tant que vecteur poétique, il concentre son activité ces dernières années sur le concert scénique et l’opéra contemporain, en collaborant notamment avec l’Orchestre de la Tonhalle de Zurich, la Kammerakademie de Potsdam, la Philharmonie de Rhénanie-Palatinat, l’Orchestre symphonique de la WDR de Cologne et l’Orchestre de l’Opéra de Lyon.
Avec la Kammerakademie de Potsdam, il travaille entre 2018 et 2022 sur le projet « Stadtteil macht Oper! ». En 2021, il dirige l’Académie Karajan de l’Orchestre philharmonique de Berlin lors de la cérémonie de réouverture de la Neue Nationalgalerie. En 2022, il collabore avec les musiciens de l’Orchestre philharmonique de Munich lors d’un concert autour de la pièce Femenine du compositeur afro-américain Julius Eastman. La même année, il fait ses débuts avec l’Akademie für Alte Musik Berlin lors de la troisième édition du festival Match Cut.
En 2023, Miguel Pérez Iñesta ouvre la saison d’opéra 2023-2024 au Théâtre national de Bolzano avec l’Orchestre Haydn. Il se rend au BeethovenFest de Bonn avec la Kammerakademie de Potsdam, est invité au festival Ultraschall avec l’ensemble Zafraan, dirige l’Orchestre symphonique de la WDR au Konzerthaus de Dortmund et l’opéra Bluthaus de Georg Friedrich Haas à l’Opéra de Lyon. Il est étroitement lié à l’ensemble parisien L’Itinéraire depuis de nombreuses années. Il fête ainsi avec eux leur 50e anniversaire avec un concert à l’IRCAM à Paris.
En tant que membre fondateur et, entre 2012 et 2017, directeur artistique de l’ensemble Zafraan de musique contemporaine, il travaille avec certains des plus grands compositeurs de notre époque, comme Helmut Lachenmann, Pierre Boulez, Tristan Murail, György Kurtág, Sofia Gubaidulina, Elena Mendoza, Stefan Keller, Eres Holz, Chaya Czernowin, Johannes Schöllhorn, Hèctor Parra, Oscar Bianchi ou Samir Odeh-Tamimi.