Ena Pongrac a fait ses études aux Universités des Arts de Graz et de Berlin. Elle approfondit sa formation avec, entre autres, Christa Ludwig, Gundula Janowitz, Brigitte Fassbaender, Anne Sofie von Otter. En 2016, elle fait ses débuts dans le rôle de Zerlina (Don Giovanni, Mozart) à l’Opéra de Jyväskylä (Finlande) où elle chante également Mercedes (Carmen, Bizet) la saison suivante.
En 2017/2018, elle incarne Hansel (Hansel et Gretel, Humperdinck) à la Junge Oper Schloss Weikersheim. Au cours de la saison 2018/2019, Ena Pongrac a été membre de l’Opéra-Studio du Théâtre de Bâle ; elle y interprète, entre autres, Alisa (Lucia di Lammermoor, Donizetti), Dinah (Trouble in Tahiti, Bernstein) et Kate Pinkerton (Madama Butterfly). En 2020/2021, elle est membre de l’ensemble du Théâtre de Bâle où elle chante la Deuxième Dame (La Flûte enchantée, Mozart) et Flora Bervoix (La Traviata). Au début de la saison 2022/2023, elle intègre la troupe du Grand Théâtre de Genève, où elle interprète, entre autres, Varvara (Katia Kabanova), Anna Kennedy (Maria Stuarda, Donizetti), une Fille-fleur et le Deuxième Écuyer (Parsifal, Wagner), Fenena (Nabucco, Verdi).